CPI-Z 139 Posted October 21 Bonjour à tous, Qui peut m'aider à installer AIDA sur PC Windows 7 ou Ubuntu 16.04 ? https://github.com/erikhom/aida exemple d'application extrait du site Share this post Link to post Share on other sites
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Meteor Drinker 405 Posted October 21 Regardes voir ici : Share this post Link to post Share on other sites
CPI-Z 139 Posted October 21 Merci Meteo Drinker, mais je suis une quiche en informatique et je ne comprends pas grand chose dans ce lien de 2011. De plus la la version de 2019 d'il y a quelques mois nécessite déjà une version de python différente et il y a Anaconda ... à paramétrer ... Share this post Link to post Share on other sites
asp06 289 Posted October 21 (edited) comme expliqué dans le manuel en pdf, tu installes anaconda 3.x et dans l'archive que tu as récupéré sur git tu configures avec les deux lignes de commande fournies et enfin tu exécutes AIDA_app.py ... Edited October 21 by asp06 Share this post Link to post Share on other sites
CPI-Z 139 Posted October 21 Et non ce n'ai pas aussi simple ça ne marche pas comme cela. Share this post Link to post Share on other sites
asp06 289 Posted October 21 je viens d'éditer à la marge ma réponse ci dessus. je vais tester sur une machine windows que j'ai sous la main. Share this post Link to post Share on other sites
Sauveur 5891 Posted October 21 pour cette commande "conda env create -f environment.yml" l faut se placé dans le repertoire d'aida ok avec cd par contre conda activate Python36 ? je sait pô Share this post Link to post Share on other sites
asp06 289 Posted October 21 (edited) tu ouvres le prompt anaconda et tu vas dans le répertoire où tu as désarchivé l'image du git, ça ressemble à ça quand je lance la commande : (base) C:\Users\xxxx\Desktop\aida-master\aida-master>conda env create -f environment.yml et ensuite tu lances directement : (base) C:\Users\xxxx\Desktop\aida-master\aida-master>python AIDA_app.py qui chez moi renvoie l'appli et un message dans le prompt : ** pyFFTW cannot be loaded/found ** j'ai tenté différentes installations de pyfftw ( https://anaconda.org/conda-forge/pyfftw ) et un redémarrage du prompt mais j'ai tout de même ce message. Edited October 21 by asp06 Share this post Link to post Share on other sites
Sauveur 5891 Posted October 21 Ca marche ok pour moi merci reste a comprendre comment ca marche 1 Share this post Link to post Share on other sites
CPI-Z 139 Posted October 21 Il y a 2 heures, Sauveur a dit : pour cette commande "conda env create -f environment.yml" l faut se placé dans le repertoire d'aida ok avec cd Après installation d'Anaconda, avec le moniteur Anaconda Prompt (Anaconda 3) puis cd jusqu'au dossier Aida-master, j'ai lancé la commande "conda env create -f environment.yml". Là c'était une chose que je n'avais pas faite (Merci Sauveur). Il semble donc que les bonnes bibliothèques soient installées. Mais la question que je me pose, sont-elles dans Anaconda-Navigator environnements base (root) ou faut-il créer une environnement spécifique avec ces bibliothèques et dans ce cas comment faire ? - Lancement de Spyder (Python 3.7) et attribuer Aida-master comme répertoire de travail utilisé (en haut à droite dans l'image) - ouverture de AIDA_app.py puis exécution (F5), la fenêtre AIDA s'ouvre bien. - donc rentrée des paramètres images input, psf input et choix dossier destination et voici le résultat où est l'erreur ? Share this post Link to post Share on other sites
CPI-Z 139 Posted October 21 après vérification la cde "conda env create -f environment.yml" n'avait pas fonctionné aussi et la liste est bien plus longue que cette capture d'écran. 1 Share this post Link to post Share on other sites
Sauveur 5891 Posted October 22 idem moi aussi j'ai crier victoire trop vite le voyant ce lancer je vais chercher et te tiens au courant si je trouve bonne journée et bon ciel Share this post Link to post Share on other sites
CPI-Z 139 Posted October 22 Sans vraiment comprendre, je crois qu'il y a 2 choses: - comment créer l'environnement "aida" dans Anaconda avec le fichier environment.yml du dossier aida-master - et comme il y a le message ** pyFFTW cannot be loaded/foud ** il faut bien faire quelque chose avec le dossier pyfftw du dossier aida-master dans Spyder ou dans l'environnement Anaconda. Mais quoi ? Share this post Link to post Share on other sites
CPI-Z 139 Posted October 23 Donc personne n'arrive a faire fonctionner ce dernier AIDA sur Windows . J'avais contacté John Sedat le Professeur du projet mais ce dernier est à la retraite depuis 2009. il m'a renvoyé vers le rédacteur du code le Dr. Erik Hom Mr. : I found Dr, Erik's address: You just have to Goggle : Dr. Erik Hom! He wrote the code! erik@olemiss.edu Dept of Biology University of Mississippe phone 662-915-1731 Best, John Sedat https://biology.olemiss.edu/erik-hom/ Peut-être quelqu'un pourrait le contacté concernant l'installation car de mon coté l'anglais n'est pas ma tasse de café et je risque de rien comprendre à ses propos ? Et si quelqu'un à réussi l'installation sur Ubuntu, je serait heureux d'en connaitre la méthode ... Merci CPI-Z Share this post Link to post Share on other sites
asp06 289 Posted October 23 (edited) sur linux mint j'ai le même problème avec pyfftw (même après une install de ce dernier avec pip) et je n'ai pas essayé le workaround proposé sur le git. l'un des contributeurs cités est franck marchis qui est francophone. Edited October 23 by asp06 Share this post Link to post Share on other sites
